MYOCAPTURE-project toont genetische oorzaken congenitale myopathie

Exoomsequencing is een techniek waarmee alle 20.000 genen van een mens in kaart kunnen worden gebracht. Het project werd ondersteund door de Franse spierziektevereniging AFM-Téléthon.

Resultaten

• Vier van de gevonden genen waren al eerder beschreven bij andere spierziekten of bij hartspierziekte (namelijk: ASCC1, HSPB8, CACNA1S, MYPN).
• Tien genen waren nieuw op dit gebied (ACTN2, CASQ1, GGPS1, MAP3K20/ZAK, ORAI1, MYO18B, PYROXD1, SRPK3, STIM1 en UNC45B).
• Bijna twee derde van de betrokken patiënten had centronucleaire myopathie (26%), core myopathie (17%), nemaline myopathie (13%) of tubulaire geaggregeerde myopathie (10%).
• De genetische afwijking in kwestie werd in 50% van de gevallen geïdentificeerd, met een sluitende diagnose in 40% van de gevallen. De resterende 10% hield verband met een variant van een kandidaat-gen die niet formeel konden worden vastgesteld (bijvoorbeeld doordat er geen bloed van familieleden beschikbaar was).
• 36% van de opgeloste gevallen had een bekend gen met een overeenkomstige uitingsvorm, terwijl 44% atypisch was voor het gen in kwestie. Met andere woorden: de meeste genetische diagnoses waren onverwacht gezien de klachten en spierkenmerken van de bijbehorende groep patiënten.
• Twintig procent van de opgeloste gevallen betrof genen die niet eerder in verband werden gebracht met een spierziekte.
• Het diagnostisch rendement was 48% wanneer het genoom van drie familieleden werd geanalyseerd, vergeleken met 29% wanneer de analyse slechts twee familieleden omvatte.
• Spierbiopsie hielp om de genetische diagnose te verbeteren, aangezien de variant in kwestie werd geïdentificeerd in 42% van de families met een biopsie, vergeleken met 14% van de families waar geen spierbiopsie beschikbaar was.

Bronnen

• The MYOCAPTURE project improves molecular understanding of congenital myopathies – Institut de Myologie Deze link opent in een nieuw tabblad;
• Exome sequencing in undiagnosed congenital myopathy reveals new genes and refines genes-phenotypes correlations – PubMed Deze link opent in een nieuw tabblad (samenvatting), PMC Deze link opent in een nieuw tabblad (volledig artikel).

Dit artikel is gecontroleerd door Sanne van de Camp, promovenda aan het Radboudumc.